El destino, o mejor dicho las condiciones de los equipos, hicieron que de los 8 elencos clasificados a la ronda de Cuartos de Final, 2 sean zarateños, 2 de Chacabuco, otros dos de la Liga Mercedina y los restantes de San Nicolás y Arrecifes. Igualmente y de acuerdo a como habían culminado la fase clasificatoria se fueron armando los cruces, defiendo en calidad de local aquellos que terminaron mejor posicionados en la tabla general.
Así será entonces como el pase a las semifinales se definirá tanto en Zárate como en Chacabuco, ya que los representativos de esas Ligas jugaron los partidos de ida en calidad de visitante y ahora deberán protagonizar las revanchas en casa. 
Teniendo en cuenta los compromisos a disputarse a lo largo de este fin de semana para determinar quiénes jugarán las semifinales de la Copa Federación 2018 serán: Defensores Unidos de Zárate vs. 12 de Octubre de San Nicolás, San Martín de Chacabuco vs. Obras Sanitarias de Arrecifes, Deportivo Sarmiento de Zárate vs. AMEFIP San Martín de Mercedes y River Plate de Chacabuco vs. Defensores Juniors de Mercedes.
